微波能和遠紅外線綜合加工鹿茸的技術已在生產中推廣應用。這些技術包括鹿茸加工的系列配套設備及加熱烘干等批量化，集中加工的新工藝。該項技術能提高鹿茸的加工質量，達到長期貯存的干燥程度，茸型完整，茸皮不破，茸頭飽滿，不空不癟，符合外貿出口鹿茸的要求，降低加工成本，改善作業條件。
(一)原理 微波能與遠紅外線結合加工鹿茸的特點是效率高，選擇性加熱，快速，節約能源，控制方便，互相取長補短，可以除去茸內不必要的水分，達到加工目的。微波的波長為30厘米以上(915兆赫)，能直接穿透茸體內部，使茸體的內外同時加熱，可大大縮短加熱時間；遠紅外線的波長為3～50微米，能使茸體表面快速加熱，水分快速脫掉。兩者結合應用可顯著提高鹿茸的加工效率和保證成品茸的質量。
(二)設備 該項新技術的配套設備有：冷藏箱、微波設備、燙茸器、遠紅外線烘干箱、鼓風箱等。
(三)加工工藝
1．加工工藝流程
(1)鮮茸加工工藝流程 鮮茸→排血(帶血茸不排血)→洗刷去污→微波加熱→燙煮茸皮→吹風冷涼→遠紅外線及微波加熱烘干→回水→煮頭造形→成品茸。
(2)鮮冷藏加工工藝流程 將零散收取的鮮茸，進行冷藏，夠批量時進行加工。其工序是：鮮茸→排血(帶血茸不排血)→洗刷去污→燙煮茸皮→冷藏保鮮→微波批量解凍、加熱→以后工藝同鮮茸加工工藝。
2．關鍵工藝
(1)微波加熱 經過燙煮的鹿茸冷至常溫后，放入微波爐內進行加熱處理。批量加工時每次可加工鮮茸10～15千克(含水 60％以上)，或半干茸20～25千克(含水約20％～30％)，使用微波功率為1.6～3.0千瓦，加熱3～5次，每次加熱2～3分鐘。兩次加熱的冷涼時間要大于加熱時間3～5倍，每次加熱后打開爐門冷涼。再加熱時關上爐門，開動機器。
(2)微波解凍 待凍存的鮮茸能滿足批量加工時，取出進行解凍處理。每次可解凍鮮茸25～30千克，使用的微波功率為3.5～6.4千瓦，一般需加熱4～6次，每次加熱時間根據箱內的負載而定，一般為2～5分鐘。
(四)注意事項
1．因微波能超過一定限度對人體有害，所以，使用前應檢查設備有無微波泄漏情況。
2．無論是加熱還是解凍，都應根據鹿茸的種類、大小、老嫩程度、規格不同，確定功率和時間。例如，花二杠茸所需的功率和時間就比花三杈茸低。
3．每次加熱后冷涼時，應注意檢查茸表的溫度，重點是大虎口、門樁的中部和嘴頭。
4．解凍時當茸體表面有水滴(或油脂滴)時，應在冷涼時用柔軟的紗布擦干，防止擊穿現象發生。
其他工藝同傳統加工工藝，加工要領也相同。