鹿茸加工結束后，用溫堿水或肥皂水刷洗茸表，再用清水刷洗，將茸體表面的油垢等物刷洗干凈(鋸口和釘眼勿沾水)，徹底擦干茸表的水分，風干一天。稱重、登記后按照規格、等級分別裝入撒有樟腦粉的木箱，放在干燥處保存，防止潮濕、鼠害、蟲蛀和丟失。長時間貯存時，應定時檢查，觀察其有無霉變和其他情況發生。
包裝運輸要求：運輸鹿茸的木箱應堅固、嚴密、輕便，四壁光滑，一般規格為80厘米×60厘米×50厘米。裝箱前應用幾層包裝紙或泡沫塑料等軟物鋪墊箱底，砍頭茸用3厘米寬的紙條 (或繃帶)，纏好茸體，頭骨用幾層紙包裹起來。頭骨對著箱角，主干朝下平放，茸間用紙團塞緊。鋸茸要分類、分等級裝箱，茸與茸之間的空隙要塞入填充物，防止磨掉茸毛或竄動甚至將茸碰壞。裝完箱后上面要蓋幾層包裝紙，加蓋并壓實、壓嚴，再將箱子捆緊。箱壁外面應貼有“防止潮濕”，“切勿倒置”等字樣，并應辦理檢疫證明，然后才可運輸。